Byggnaden av museet, designad av arkitekter från Nizio Design International, är imponerande ur ett arkitektoniskt perspektiv. Dess moderna form, som påminner om ett monumentalt stålskrov av ett fartyg, hänvisar till Gdańsks tradition som hamnstad och dess roll i Europas historia. Ingången till museet leder genom ett stort utrymme som symboliserar en port till det förflutna, och interiörerna är designade för att möjliggöra ett djupgående engagemang med krigets händelser.
Huvudutställningen på museet syftar till att presentera andra världskriget ur ett globalt perspektiv, som inte bara omfattar slag och militära åtgärder utan också deras påverkan på vardagslivet för vanliga människor, samhälle och kultur. Besökare får möjlighet att se hur kriget påverkade olika regioner i världen, vilka konsekvenser det hade för olika nationer och vilken betydelse det hade i samband med den föränderliga internationella ordningen.
Museet rymmer många artefakter, såsom vapen, uniformer, dokument, fotografier, brev, samt fragment av förstörda byggnader och andra krigsminnen. Många av dessa föremål kommer från privata samlingar och donationer från dem som överlevde kriget och ville lämna ett vittnesbörd om sina erfarenheter. Utställningen omfattar också teman relaterade till nationella uppror, motståndsrörelsen och de sociala förändringar som kriget medförde.