Budynek muzeum zaprojektowany przez architektów z pracowni Nizio Design International jest imponujący pod względem architektonicznym. Jego nowoczesna forma przypominająca monumentalny stalowy kadłub statku, nawiązuje do tradycji Gdańska jako portowego miasta i jego roli w historii Europy. Wejście do muzeum prowadzi przez wielką przestrzeń, która symbolizuje wrota do przeszłości, a wnętrza są zaprojektowane w taki sposób, aby pozwalały na płynne zanurzenie się w wydarzeniach wojennych.
Główna ekspozycja muzeum ma na celu przedstawienie II wojny światowej z globalnej perspektywy, uwzględniając nie tylko bitwy i działania militarne, ale także ich wpływ na codzienne życie zwykłych ludzi, społeczeństwa i kulturę. Zwiedzający mają okazję zobaczyć, jak wojna dotknęła różne regiony świata, jakie były jej konsekwencje dla poszczególnych narodów i jakie miała znaczenie w kontekście zmieniającego się porządku międzynarodowego.
W muzeum znajdują się liczne artefakty, takie jak broń, mundury, dokumenty, fotografie, listy, a także fragmenty zniszczonych budynków i inne pamiątki wojenne. Wiele z tych przedmiotów pochodzi z kolekcji prywatnych oraz darów osób, które przeżyły wojnę i chciały pozostawić świadectwo swoich doświadczeń. Ekspozycja obejmuje także wątki związane z powstaniami narodowymi, ruchem oporu, a także zmianami społecznymi, jakie zachodziły w wyniku wojny.